Interdisziplinäres Zentrum
für Bioinformatik


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LIFE - Transcriptomics Group

Bioinformatik Uni Leipzig

http://www.life.uni-leipzig.de

Methoden der Informatik, Datenbanken, Datenintegration für bioinformatische Aufgabenstellungen


Koordinator: Prof. Dr. Erhard Rahm
Partner: Institut für Informatik der Fakultät für Mathematik und Informatik, MPI für Evolutionäre Anthropologie
IZBI: Michael Hartung, Toralf Kirsten, Jörg Lange


Im Fokus der Arbeitsgruppe steht die flexible Verwaltung und Integration von umfangreichen und heterogenen molekularbiologischen Daten und Annotationen. Solche Daten fallen aufgrund neuer Technologien z.B. Microarrays sowie weltweiter Forschungsanstrengungen in großem Umfang an und ermöglichen viele neuartige Untersuchungen in den Lebenswissenschaften.
Um den unterschiedlichen Arten von Daten sowie Analyseanforderungen von Forschungsprojekten Rechnung zu tragen, wurden in der Arbeitsgruppe mehrere neue Datenbanken und Integrations- und Analyseplattformen entwickelt. Das methodische Repertoire umfasst die physische Integration unterschiedlicher Daten innerhalb von Data Warehouses, die virtuelle Integration mehrerer Datenquellen über Mediator-Schnittstellen sowie hybride Strategien.